Kan örneklerinden izole edilen Candida parapsilosis kompleks suşlarının tür düzeyinde tanımlanması ve antifungal duyarlılıklarının belirlenmesiBurcu Dalyan Cilo1, Harun Agca2, Beyza Ener21Sağlık Bilimleri Üniversitesi Bursa Yüksek İhtisas Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji/ Tıbbi Mikoloji, Bursa 2Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı, Bursa
GİRİŞ ve AMAÇ: Dünyada ve ülkemizde birçok merkezde, fırsatçı bir enfeksiyon olan kandidemilere ikinci sıklıkta neden olan tür Candida parapsilosis tür kompleksidir. Bu tür kompleksi içinde yer alan C. parapsilosis sensu stricto, C. orthopsilosis ve C. metapsilosis türleri fenotipik olarak birbirinden ayrılamaz ve tanımlamaları için çeşitli moleküler yöntemlere ihtiyaç duyulur. Bu çalışmada da, laboratuvarımızda kan kültürlerinden izole edilen C. parapsilosis tür kompleksi suşlarının antifungal duyarlılıklarının incelenmesi ve tür düzeyinde tanımlanma yapılması amaçlanmıştır. YÖNTEM ve GEREÇLER: Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı stoklarından canlandırılan 118 kan izolatı kullanıldı. İzolatların flukonazol, vorikonazol, itrakonazol, posakonazol amfoterisin B ve anidulafungine in vitro duyarlılığı CLSI M27 dokümanına göre saptandı. C. parapsilosis tür kompleksindeki türler, sekonder alkol dehidrogenaz enzimini kodlayan gen bölgesinin (SADH) “polimeraz chain reaction-restriction fragment length polymorphism” (PCR-RFLP) yöntemiyle incelenmesiyle belirlendi. BULGULAR: Bu çalışmada kan kültürlerinden izole edilen 118 C. parapsilosis tür kompleksi suşunda flukonazol direncinin %26,3 oranında olduğu, amfoterisin B ve anidulafunginde ise direncin yok denecek kadar az olduğu saptandı. Antifungal duyarlılığı belirlenen bu suşlar arasında C. orthopsilosis ve C. metapsilosis türlerine rastlanmadı. TARTIŞMA ve SONUÇ: Bu çalışma ile merkezimizdeki C. parapsilosis tür kompleksindeki yüksek flukonazol direncinin kompleks içindeki türlerle ilişkili olmadığı görüldü. Suşlar arasındaki klonal ilişkinin ve direncin genetik temellerinin araştırılması için ek çalışmaların yapılması gerektiği sonucuna varıldı.
Anahtar Kelimeler: Candida parapsilosis tür kompleksi, Antifungal duyarlılık, PCR-RFLP
Identification of Candida parapsilosis Complex Strains Isolated from Blood Samples at Species Level and Determination of Their Antifungal SusceptibilitiesBurcu Dalyan Cilo1, Harun Agca2, Beyza Ener21 2
INTRODUCTION: Candida parapsilosis species complex is the second most common cause of candidiasis which is an opportunistic infection, in many centers in the world and in our country. Candida parapsilosis sensu stricto, Candida orthopsilosis and Candida metapsilosis within this species complex are indistinguishable from each other phenotypically and various molecular methods are needed for their identification. In this study, we aimed to investigate the antifungal susceptibility of C. parapsilosis species complex isolated from blood cultures in our laboratory and to identify them at species level. METHODS: A total of 118 blood isolates from the stock culture of Uludağ University Faculty of Medicine Department of Microbiology were used. The in vitro sensitivity of the isolates to fluconazole, voriconazole, itraconazole, posaconazole, amphotericin B and anidulafungin was determined according to the CLSI-M27 document. The species in the C. parapsilosis species complex were determined by the investigation of the gene region encoding the secondary alcohol dehydrogenase enzyme (SADH) using “polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism” (PCR-RFLP) method RESULTS: In this study, fluconazole resistance was found to be 26.3% in the 118 C. parapsilosis species complex isolated from blood cultures, and the resistance to amphotericin B and anidulafungin was almost none. There were no C. orthopsilosis and C. metapsilosis species among these strains. DISCUSSION AND CONCLUSION: In this study, it was shown that high fluconazole resistance in C. parapsilosis species complex in our center was not associated with different species in the complex. It is concluded that additional studies should be done to search for clonal relationship between strains and genetic basis of resistance.
Keywords: Candida parapsilosis species complex, antifungal susceptibility, PCR-RFLP
Burcu Dalyan Cilo, Harun Agca, Beyza Ener. Identification of Candida parapsilosis Complex Strains Isolated from Blood Samples at Species Level and Determination of Their Antifungal Susceptibilities. . 2019; 49(2): 61-66
Sorumlu Yazar: Burcu Dalyan Cilo, Türkiye |
|