• 1. 黑龙江中医药大学第一临床医学院(哈尔滨 150040);
  • 2. 哈尔滨市道里区人民医院妇科(哈尔滨 150040);
  • 3. 黑龙江中医药大学附属第二医院国医堂(哈尔滨 150040);
  • 4. 黑龙江中医药大学附属第一医院妇一科(哈尔滨  150040);
导出 下载 收藏 扫码 引用

目的  利用生物信息学探讨多囊卵巢综合征中环状 RNA(circular RNA,circRNA)的差异表达,并预测与之相结合的微 RNA(microRNA,miRNA)。方法  通过基因表达综合数据库查找多囊卵巢综合征的卵丘细胞基因芯片表达谱,采用数据库自带的 GEO2R 工具筛选出差异 circRNA,并利用 DAVID 6.8 数据库对差异 circRNA 基因进行基因本体分析及京都基因和基因组数据库信号通路分析,使用 Circular RNA interactome 预测潜在调控的 miRNA,并利用 Cytoscape 软件建立 circRNA-miRNA 网络图,预测差异最显著的上调和下调的 circRNA 潜在调控的 miRNA 各 5 个。结果  共获得多囊卵巢综合征差异 circRNA 247 个,预测到与上调 circRNA 基因结合的 miRNA 共 277 个,与下调 circRNA 基因结合的 miRNA 共 125 个,前 10 个能够与多个差异 circRNA 结合的 miRNA 分别为 hsa-miR-557、hsa-miR-507、hsa-miR-224、hsa-miR-136、hsa-miR-127-5p、hsa-miR-579、hsa-miR-502-5p、hsa-miR-186、hsa-miR-1253、hsa-miR-432。结论  circRNA 的差异表达分析有利于了解 circRNA 在多囊卵巢综合征中发挥的主要作用,分析预测潜在调控的 miRNA 能帮助了解该病的相关发病机制。

引用本文: 吴登辉, 于津澜, 张蛟, 杨丽珍, 孙玉华, 张跃辉. 多囊卵巢综合征中环状 RNA 差异表达的生物信息学分析. 华西医学, 2022, 37(2): 231-236. doi: 10.7507/1002-0179.202012054 复制

  • 上一篇

    H2AFX 基因在肺腺癌中的表达及对预后的影响
  • 下一篇

    OPRM1 A118G 基因多态性与艾森克人格类型和疼痛敏感性相关性研究