Editorial

Laboratory tests for diagnosis of Clostridium difficile infection: Past, present, and futurePruebas de laboratorio para el diagnóstico de la infección por Clostridium difficile: pasado, presente y futuro

Las técnicas de diagnóstico rápido son herramientas de gran valor en el diagnóstico de las infecciones gastrointestinales, especialmente para la detección de algunos microorganismos y en determinados grupos de pacientes. Mientras que las técnicas de detección de antígeno son práctica habitual en los laboratorios de microbiología clínica para el diagnóstico de virus, algunos parásitos y algunas bacterias, las técnicas moleculares se utilizan de manera rutinaria solo para determinados patógenos (como Clostridium difficile). Sin embargo, son técnicas en constante evolución que permiten el diagnóstico rápido de un número cada vez mayor de patógenos con una elevada sensibilidad y especificidad y también permiten la detección de factores de virulencia o mecanismos de resistencia. Los sistemas de diagnóstico sindrómico, que detectan diferentes patógenos de forma simultánea, son muy prometedores porque permiten diagnosticar en pocas horas los patógenos más frecuentes y pueden ser de gran utilidad en determinados pacientes.

Para el diagnóstico de la infección por Helicobacter pylori las técnicas moleculares, que pueden detectar tanto la bacteria como su resistencia a claritromicina y levofloxacino, permiten seleccionar el tratamiento más adecuado para cada paciente cuando el cultivo de la bacteria no es posible.

Rapid diagnostic techniques are valuable tools in the diagnosis of gastrointestinal infections, especially for the detection of some microorganisms and in certain groups of patients. While antigen detection techniques are widely used in Clinical Microbiology laboratories, for the diagnosis of viruses, some parasites and some bacteria, molecular techniques are routinely used only for some pathogens (such as Clostridium difficile). However, molecular techniques are constantly evolving, and they allow a rapid diagnosis for an increasing number of pathogens, with high sensitivity and specificity. In addition, they are also able to detect virulence factors or resistance mechanisms. Syndromic surveillance systems, which detect different pathogens simultaneously, are very promising because they enable the most frequent pathogens to be diagnosed in a few hours and they can be very useful in certain patients.

For the diagnosis of Helicobacter pylori infection, molecular techniques are able to detect bacteria and its resistance to clarithromycin and levofloxacin, allowing the most appropriate treatment to be selected for each patient when bacterial culture is not possible.

La infección por Clostridium difficile (ICD) es la principal causa de diarrea nosocomial en países industrializados y el origen de un número de casos cada vez mayor de diarrea en la comunidad. La irrupción de la cepa del ribotipo 027 ha incrementado en algunos países la incidencia y la gravedad de la ICD. Aunque suele cursar como una diarrea leve/moderada, puede dar lugar a formas graves, como megacolon tóxico y shock séptico. Uno de cada 2 episodios de ICD no es diagnosticado en los hospitales españoles por falta de sospecha clínica o por el uso de métodos diagnósticos poco sensibles. Se recomiendan algoritmos diagnósticos basados en la detección de glutamato deshidrogenasa y en la detección molecular de los genes de las toxinas con o sin la detección directa de las toxinas. El tratamiento recomendado de la ICD depende del tipo de infección y las características del paciente.

Clostridium difficile infection (CDI) is the main cause of nosocomial diarrhea in industrialized countries and the source of a growing number of cases of diarrhea in the community. The outbreak of the hypervirulent strain belonging to ribotype 027 has increased the incidence and severity of CDI in some countries. Although CDI usually courses as a mild diarrhea it can lead to severe forms such as toxic megacolon or septic shock. One of every 2 episodes of CDI is not diagnosed in Spanish hospitals due to a lack of clinical suspicion or the use of insensitive diagnostic methods. The diagnostic techniques of choice are algorithms based on the detection of glutamate dehydrogenase and molecular detection of the genes of the toxins with or without the direct detection of the toxins. The recommended treatment for CDI depends on the type of infection and the characteristics of the patient.

Clostridium difficile es la primera causa de diarrea nosocomial en los países desarrollados y uno de los principales agentes etiológicos de diarrea comunitaria. La irrupción de la cepa hipervirulenta BI/NAP1/027 ha dado lugar a un incremento de la morbimortalidad de la infección por C. difficile (ICD). Este documento pretende revisar tanto los principales cuadros clínicos de la ICD como el diagnóstico de laboratorio, incluyendo la toma de la muestra, su transporte y conservación, su procesamiento, los distintos procedimientos diagnósticos disponibles, las pruebas de sensibilidad a antibióticos y la caracterización molecular de los aislados. El propósito principal de los autores ha sido elaborar un documento eminentemente práctico que dé respuesta a las principales dudas que surgen en el diagnóstico de laboratorio de la ICD.

Clostridium difficile is the leading cause of nosocomial diarrhoea in developed countries, and is one of the main aetiologic agents of community diarrhea. The eruption of the hypervirulent strain BI/NAP1/027 has given rise to an increase in the morbidity and mortality of C. difficile infection (CDI). This document aims to review the main clinical pictures of CDI and the laboratory diagnosis, including sampling, transport and storage of specimens, specimen processing, diagnostic procedures, antimicrobial susceptibility testing, and molecular characterisation of the isolates. The main purpose of the article is to develop a practical document that provides answers to the main questions that arise in the laboratory diagnosis of CDI.

Reported prevalence rates of Clostridium difficile infection in animals differ considerably depending on the nature of the study and the population surveyed. The methods used to recover this organism from faecal samples may account for some of the prevalence variation. The objective of this study was to assess the performance of two different methods of detecting C. difficile in animal faeces in comparison with a conventional isolation procedure (‘ethanol shock’ of faecal samples followed by culture on a single plate of solid selective medium). Samples were obtained from two populations of pigs where the expected prevalence rate of C. difficile infection was anticipated to differ, namely, ‘high prevalence’ (<7-day old piglets) and ‘low prevalence’ (2–3-month old pigs).

The first alternative detection method required culturing faecal samples on 10 (instead of one) plate of solid selective medium after ethanol shock, while the second method included an intermediate enrichment step in selective broth prior to ethanol shock and subsequent plating. Both alternative methods considerably increased bacterial recovery in tested samples from both surveyed populations and highlighted the existence of a considerable proportion (⩾22%) of false negatives. The results confirm previous suggestions that the procedure used to isolate C. difficile can have a significant impact on prevalence data for this pathogen.