長久以來我國港口一直以行政機關的組織型態經營管理，由於缺乏積極的誘因機制與層層法規管制使我國國際港埠在日益競爭的海運市場中漸居劣勢。高雄港三年前仍是世界第三大貨櫃港，如今已被中國大陸上海塩田超越而淪為第六名，前景令人擔憂。高雄港所面臨的國際競爭日益激烈，如何提升競爭力，為顧客提供優質的港口服務以追求永續成長的經營環境，已成為港務局組織轉型的策略性議題。 關於港務局組織轉型議題曾歷經交通部與行政院經建會多次協議，截至目前較被各方所青睞的組織型態則為人事、採購、預算與會計獨立自主的特殊公法人組織。 控照交通部所規劃內容，港務局將涉及公權力的航政監理業務移轉出並由新成立的航政局承接辦理，服務性公權力業務與一般港口經營業務依然保留在港務局業務範圍內，祇是各港口的港務局名稱改為各港特殊公法人。本文將以交通部目前所規劃的各港特殊公法人之內容為基礎，以經濟誘因與效率的角度探討其可能存在的問題；並強調不同的組織型態對達成不同性質的業務目標之有效性。希望能對港務局組織改造提供跳出既定模式的思考空間。