Modèles et méthodes pour l’évolution biologique

Modèles d’évolution pour les séquences et les caractères discrets

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Résumé :

Un modèle d'évolution permet d'associer une probabilité à l'évènement « passer de l'état A à l'état B en un temps donné » pour le caractère d'intérêt. Le calcul des arbres d'évolution repose pour l'essentiel sur des modèles d'évolution de séquences génétiques, où le caractère d'intérêt est le nucléotide ou l'acide aminé présent à un site donné. Ce chapitre présente les modèles de Markov en temps continu qui sont à la base des principaux modèles d’évolution de séquences et de caractères discrets.