ОБЛАСТЬ КОНТАКТОВ КЛАСТЕРОВ ГЕНОВ РРНК С ГЕНОМ FANK1 СООТВЕТСТВУЕТ НЕАКТИВНОМУ ХРОМАТИНУ
Гены рРНК играют важную роль в дифференцировке клеток и эпигенетической регуляции экспрессии многих генов. Нами проведен анализ мест контактов кластеров генов рРНК человека с помощью метода 4С (circular chromosome conformation capture). В области хромосомы 10 обнаружены частые контакты кластеров генов рРНК в 5''-концевой области гена FANK1. Места контактов совпадают с границей изменения состояний хроматина и фазирования нуклеосом. Соседние гены DHX32, BCCIP и UROS не имеют контактов с генами рРНК, расположены в активном хроматине и по данным РНК-секвенирования активно транскрибируются, тогда как ген FANK1 практически не транскрибируется и находится в неактивном хроматине. Тепловой шок приводит к нарушению большей части контактов с генами рРНК и активации транскрипции гена FANK1 почти в 4 раза. Предполагается, что контакты генов рРНК могут вызывать сайленсинг гена FANK1 в клетках HEK293T.