مقایسه تنوع ژنتیکی ماهی شیپ ( Acipenser nudiventris ) در سواحل جنوبی دریای خزر و رودخانه اورال بااستفاده از روش PCR-RFLP

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 رشت

2 نور

چکیده

 



تنوع ژنتیکی ماهی شیپ (Acipenser nudiventris) دریای خزر با استفاده از ژنهای دهیدروژناز 5 و 6 (NADH5.6) و روش PCR-RFLP مورد بررسی قرار گرفت. برای این منظور 80 عدد ماهی شیپ از سواحل جنوبی دریای خزر و رودخانه اورال در قزاقستان جمع آوری گردید. ژن ND5.6 ژنوم میتوکندریایی بوسیله PCR تکثیر و سپس با 39 آنزیم برشگر اندونوکلئاز هضم گردید. از 39 آنزیم پنج آنزیم برشگرHaeIII، DraI، MboI TasI، Cfr13I تنوع چند شکلی از خود نشان دادند. در مجموع بین نمونه های بررسی شده 10 ترکیب هاپلوتیپی بدست آمد که از بین هاپلوتیپ های شناخته شده هاپلوتیپ AAAAA بیشترین فراوانی (75.5 درصد) را داشت. دو هاپلوتیپ BABAA، BBAAA حداقل فراوانی (1.2 درصد) را نشان دادند و هاپلوتیپ AAAAB با فراوانی (5 درصد) مختص نمونه های رودخانه اورال بوده است. میانگین تنوع هاپلوتیپی و نوکلئوتیدی بترتیب 0.5816 و 0.007 درصد بدست آمد. میزان تنوع نوکلئوتیدی بدست آمده در این بررسی نسبت به سایر تاسماهیان دریای خزر (تاسماهی ایرانی، روسی و ازون برون) بسیار پایین تر بوده است که این امر می تواند ناشی از کوچک بودن اندازه جمعیتهای این گونه باشد. آنالیز آماری و شبیه سازی Monte-Carlo با 1000 بار تکرار نشان داد که توزیع هاپلوتیپ ها در بین مناطق مختلف نمونه برداری در جنوب دریای خزر اختلاف معنی داری ندارد (P=0.74، X2=35.48) اما بین جمعیت شیپ رودخانه اورال و حوضه جنوبی دریای خزر اختلاف معنی داری وجود دارد (P=0.00، 137.35=X2). نتایج این بررسی نشان می دهد که جمعیت ماهی شیپ رودخانه اورال از جمعیت ماهی شیپ در سواحل جنوبی دریای خزر متفاوت است و آنزیم Cfr13I یک مارکر مولکولی جهت تمایز این دو جمعیت می باشد.

کلیدواژه‌ها

عنوان مقاله [English]

Comparison of genetic variation of Ship sturgeon (Acipenser nudiventris) in the southern Caspian Sea and Ural River using PCR-RFLP

نویسندگان [English]

  • A. Ghasemi 1
  • M. Porkazemi 1
  • M. Kalbasi 2
1 Rasth
2 Noor
چکیده [English]

Genetic variation of ship sturgeon (Acipenser nudiventris) from the Caspian Sea was investigated using NADH5/6 gene and PCR-RFLP analysis. A total of 80 specimens of the fish were collected from the south Caspian Sea and the Ural River from Kazakhstan. mtDNA ND5/6 gene was amplified by polymerase chain reaction (PCR) digested using 39 Endonucleases Restriction Enzyme. Of the 39 enzymes, five showed polymorphism. Totally, ten composite haplotypes among 80 specimens were detected. Haplotype AAAAA showed maximum frequency (57.5%) whereas haplotypes BBAAA and BABAA showed minimum frequency (1.2%). Haplotype AAAAB was recognized specifically in Ural River specimens. Average haplotype and nucleotide diversity was 0.8516 and 0.007 respectively. Compared to other sturgeon species living in the Caspian Sea, nucleotide diversity of Ship Sturgeon was much lower (0.007). This may be due to smaller population size of this species. Monte-Carol simulation using 1000 interaction did not show any sig.....

مجله علمی شیلات ایران
دوره 14، شماره 4
آذر و دی 1384
صفحه 151-164

فایل ها

هم رسانی

ارجاع به این مقاله

آمار