Original Article
Identification and molecular characterization of Roseomonas genomospecies 5 isolated from Umbilical Cord Blood UnitIdentificación y caracterización molecular de Roseomonas genomospecies 5 aislada de Unidad de Sangre de Cordón Umbilical

https://doi.org/10.1016/j.hgmx.2016.05.003Get rights and content
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Abstract

Introduction

Roseomonas is rarely involved in pathology but represents an important case of contamination when is associated to hematopoietic stem cells, having intrinsic resistance to multiple classes of antibiotics and the ability to gain new resistance factors. This is a report that follows a previous identification of contamination microorganisms in the cryopreserved Umbilical Cord Blood Units (UCBU) stored in the Cord Blood Bank (CBB) of the National Center of Blood Transfusion (NCBT) at Mexico City.

Objective

Phenotypic and molecular characterization of Roseomonas genomospecies 5 isolated from UCBU.

Materials and methods

Phenotypic enzyme diffusion tests in solid phase (proteases, amylases, hemolysins and lipases detection) and antimicrobials (for Gram negative bacteria) resistance tests were performed to determine the potential virulence and resistance of the strain isolated of the Umbilical Cord Blood Unit 2191. Additional PCR assays were performed to determine the presence of genetic elements associated to antimicrobial resistance: bla genes and Class 1 integrons. Also, a 16S rRNA gene sequence analysis was done on microbial strains isolated from UCBU.

Results

Broad-spectrum penicillins, third generation cephalosporins, and fluoroquinolones did not show inhibitory activity in the 2191 strain. We could only identify extracellular amylase activity. Gene detection by PCR of encoding antimicrobial resistance (β-lactamases) and Class 1 integrons revealed the presence of bla–HSV and bla–TEM variants in the 2191 strain. Phylogenetic analysis revealed the presence of Roseomonas genomospecies 5 in the 2191 UCBU (named 2191 strain).

Conclusions

This is the first report on the isolation of Roseomonas genomospecies 5 in a UCBU for transplantation, an unusual bacteria isolated from umbilical cord blood, associated with a possible immunosuppression in the donor. Its presence in UCBU can be fatal in immunocompromised patients if it were used for transplantation of Hematopoietic Stem Cells (HSC), due to the potential virulence of the strains and the resistance to antimicrobials commonly used.

Resumen

Introducción

Roseomonas es poco común y normalmente no es patógena, sin embargo, representa un caso importante de contaminación cuando se asocia al transplante de Células Troncales Hematopoyéticas, debido a que presentan resistencia a múltiples clases de antibióticos y la habilidad de ganar nuevos factores de resistencia. Este reporte es la continuación de la idenficación de los microorganismos contaminantes en las Unidades de Sangre de Cordón Umbilical (USCU) criopreservadas en el Banco de Sangre de Cordón (BSC) del Centro Nacional de la Transfusión Sanguínea (CNTS) en la ciudad de México.

Objetivo

Caracterización fenotípica y molecular de Roseomonas genomospecies 5 aislada de USCU.

Materiales y métodos

Se realizaron pruebas fenotípicas y de difusión enzimática en fase sólida (detección de proteasas, amilasas, lipasas, hemolisinas) y antimicrobianos (para bacterias Gram negativas) para determinar el potencial de virulencia y resistencia de la cepa aislada de la unidad de sangre de cordón umbilical 2191. Adicionalmente se realizaron ensayos de PCR para determinar la presencia de elementos genéticos asociados a la resistencia a antimicrobianos: genes bla e Integrones de Clase 1. También se realizó un análisis de la secuencias del gen 16S rRNA de las cepas aisladas de USCU.

Resultados

Las penicilinas de amplio espectro, cefalosporinas de tercera generación y las fluoroquinolonas no mostraron actividad inhibitoria en la cepa 2191. Sólo se identificó la actividad amilolítica extracelular. La detección de genes mediante PCR reveló la presencia de dos genes codificantes a β-lactamasas (variantes bla-HSV y bla-TEM) y no se detectaron elementos de Integrones de Clase 1 en el genoma de la cepa 2191. El estricto análisis filogenético reveló la presencia de Roseomonas genomospecies 5 en la USCU 2191 (nombrada cepa 2191).

Conclusiones

Este es el primer reporte sobre el aislamiento de Roseomonas genomospecies 5 en USCU para el trasplante; una bacteria inusual aislada de USCU, asociada con una posibe inmunosupresión en el donante. Concluyendo que la presencia de Roseomonas genomospecies 5 en USCU puede ser fatal en pacientes inmunocomprometidos si fueran utilizadas para el trasplante de células troncales hematopoyéticas, debido a que esta cepa presenta potencial de virulencia y resistencia a los antimicrobianos utilizados comúnmente.

Keywords

Umbilical Cord Blood Unit
Roseomonas
Bacterial contamination
Virulence potential

Palabras clave

Unidad de Sangre de Cordón Umbilical
Roseomonas
Contaminación bacteriana
Potencial virulento

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