Zusammenfassung
Die Einführung des „next generation sequencing“ revolutioniert nicht nur die molekulare Genetik und Forschung, sondern auch die Diagnostik von genetisch bedingten Erkrankungen. Die neuen Sequenzierungsmethoden ermöglichen eine zeitgleiche und kostengünstige Analyse tausender Gene, was die genomweite Suche nach genetischen Erkrankungsursachen in Forschung und Diagnostik ermöglicht. In der Forschung eröffnen sich neue Felder durch die Identifizierung und Charakterisierung neuer Gene und Genvarianten. In der Diagnostik werden Techniken wie die Exomsequenzierung etablierte Methoden in naher Zukunft teilweise ersetzen. Es ist zu erwarten, dass automatisierte, zeitsparende und kosteneffiziente Sequenzierungsmethoden sowohl die Diagnosestellung als auch die Behandlung vereinfachen und beschleunigen. Dies gilt nicht nur für metabolische, sondern auch für andere Arten von Erkrankungen.
Abstract
The introduction of next generation sequencing is revolutionizing not only molecular genetics and different fields of research but also the diagnostics of genetic diseases. The new sequencing methods facilitate a simultaneous and cost-efficient analysis of thousands of genes which allows a genome-wide search for disease mutations in research and diagnostic settings. The identification of new genes and gene variants discloses new fields in research. Furthermore methods such as exome sequencing will largely replace established diagnostic methods in the future. It is to be expected that automated, cost-saving and time-saving sequencing methods will simplify and accelerate diagnosis and treatment of patients not only with metabolic but also with other kinds of diseases.
Literatur
Applied Biosystems (1995) Applied Biosystems™, Carlsbad, CA. www.appliedbiosystems.com/absite/us/en/home/applications-technologies/dna-sequencing-fragment-analysis/instruments-accessories.html
Broad Institute (2011) Integrative genomics viewer (IGV). Broad Institute, Cambridge, http://www.broadinstitute.org/igv/
Haack TB, Danhauser K, Haberberger B et al (2010) Exome sequencing identifies ACAD9 mutations as a cause of complex I deficiency. Nat Genet 42:1131–1134
Illumina (2011) Illumina®, San Diego, CA: www.illumina.com/systems/sequencing.ilmn
Kingsley CB (2011) Identification of causal sequence variants of disease in the next generation sequencing era. Methods Mol Biol 700:37–46
Ku CS, Naidoo N, Pawitan Y (2011) Revisiting Mendelian disorders through exome sequencing. Hum Genet 129:351–370
Kuhlenbaumer G, Hullmann J, Appenzeller S (2011) Novel genomic techniques open new avenues in the analysis of monogenic disorders. Hum Mutat 32:144–151
Levene MJ, Korlach J, Turner SW et al (2003) Zero-mode-waveguides for single-molecule analysis at high concentrations. Science 299:682–686
Margulies M, Egholm M, Altmann WE et al (2005) Genome sequencing in microfabricated high-density picolitre reactors. Nature 437:376–389
Ng SB, Nickerson DA, Bamshad MJ, Shendure J (2010) Massively parallel sequencing and rare disease. Hum Mol Genet 19:R119–R124
Sanger F, Coulson AR (1975) A rapid method for determining sequences in DNA by primed synthesis with DNA polymerase. J Mol Biol 94:441–446
Sanger F, Nicklen S, Coulson AR (1977) DNA sequencing with chain-terminating inhibitors. Proc Natl Acad Sci USA 74:5463–5467
Shendure J, Porreca GJ, Reppas NB et al (2005) Acurate multiplex polony sequencing of an evolved bacterial genome. Sci 309:1728–1732
Smith LM, Sanders JZ, Kaiser RJ et al (1986) Fluorescence detection in automated DNA sequence analysis. Nature 321:674–679
Interessenskonflikt
Der korrespondierende Autor gibt an, dass kein Interessenkonflikt besteht.
Author information
Authors and Affiliations
Corresponding author
Rights and permissions
About this article
Cite this article
Hempel, M., Haack, T., Eck, S. et al. „Next generation sequencing“. Monatsschr Kinderheilkd 159, 827–833 (2011). https://doi.org/10.1007/s00112-011-2446-y
Published:
Issue Date:
DOI: https://doi.org/10.1007/s00112-011-2446-y
Schlüsselwörter
- Molekulare Genetik
- „Next generation sequencing“
- Exomsequenzierung
- Stoffwechselerkrankungen
- Genetische Untersuchung